Performance de l'extension d'utilisation du kit Filmarray® panel BCID pour l'analyse des lavages broncho-alvéolaires
| Titre | Performance de l'extension d'utilisation du kit Filmarray® panel BCID pour l'analyse des lavages broncho-alvéolaires |
| Type | Thèse d'exercice : Pharmacie |
| Auteurs | Sansot Maxime |
| Directeurs | Pailhoriès Hélène |
| Année | 2018 |
| URL | http://dune.univ-angers.fr/fichiers/20090241/2018PDEBM9796/fichier/9796F.pdf |
| Mots-clés | Approche syndromique, D.E.S, infection nosocomiale, PCR multiplex, Pneumonie acquise sous ventilation mécanique |
| Résumé | Les pneumopathies acquises sous ventilation mécanique (PAVM) sont la première cause d’infection nosocomiale dans les services de réanimation. Elles sont responsables d’une augmentation de la morbi-mortalité ainsi que des durées d’hospitalisation prolongées. Un diagnostic précoce est crucial afin d’introduire une antibiothérapie efficace. Un kit de PCR multiplexe tel que le FilmArray® BCID panel permettrait une adaptation précoce de l’antibiothérapie. Nous avons testé Le kit Filmarray® panel BCID sur 50 Lavages bronchalvéolaires (LBA), provenant de patients hospitalisés dans 2 services de réanimation au CHU d’Angers, en comparaison des cultures de routine. Le pourcentage de concordance globale observé entre la culture (bactéries pathogènes ≥ 104 UFC/mL) et le panel BCID était de 97,9 % avec un coefficient Kappa de Cohen de 0.77 (IC 95% : 0,67 – 0,88). Le pourcentage de concordance positive était de 88,6% (IC 95% : 72,3 – 96,3%). Le pourcentage de concordance négative était de 98,3% (IC 95% : 97 – 99,1%). Le kit FilmArray® BCID a montré une sensibilité de 100% et une spécificité de 98%, pour des germes ≥ 104 UFC/mL à la culture et inclus dans le panel. La spécificité variait de 87% pour Haemophilus influenzae à 100% pour Klebsiella pneumoniae. En tenant compte d’un examen direct positif le test FilmArray® montrait une sensibilité de 94,7% et une spécificité de 97,9% avec une valeur prédictive négative de 99,6% et une valeur prédictive positive de 78,3%. L’étude montre de bonnes performances du panel BCID pour l’analyse des LBA. Devant un examen direct positif, ce test permet d’obtenir des résultats fiables dans un délai très précoce. La question est de déterminer s’il apportera réellement une plus-value sur la prise en charge du patient. Des études coûts-bénéfices devront être réalisées pour l’évaluer. |
| Résumé en anglais | Ventilator associated pneumonia (VAP) is the main cause of nosocomial infection in intensive care units. They are responsible for an increase in morbidity and mortality as well as prolonged hospital stays. Early diagnosis is crucial in order to introduce effective antibiotic therapy. A multiplex PCR kit such as the FilmArray® BCID panel would allow early adaptation of antimicrobial therapy. We tested the Filmarray® BCID panel on 50 bronchalveolar lavages (BAL), from patients hospitalized in 2 intensive care units at the Angers University Hospital, compared to conventional culture based method. The overall agreement observed between the culture (pathogenic bacteria ≥ 104 CFU/mL) and the BCID panel was 97.9% with a Cohen Kappa coefficient of 0.77 (95% CI: 0.67 - 0.88). The percentage of positive agreement was 88.6% (95% CI: 72.3 - 96.3%). The negative agreement percentage was 98.3% (95% CI: 97 - 99.1%). The BCID FilmArray® kit showed 100% sensitivity and 98% specificity, for germs ≥ 104 CFU/mL to culture and included in the panel. Specificity ranged from 87% for Haemophilus influenzae to 100% for Klebsiella pneumoniae. Considering a positive direct examination, the FilmArray® test showed a sensitivity of 94.7% and a specificity of 97.9% with a negative predictive value of 99.6% and a positive predictive value of 78.3%. The study shows good performance of the BCID panel for BAL fluid analysis. In front of a positive direct examination, this test allows reliable results to be obtained at a very early stage. The question is whether it will really add value for clinical outcomes by using BCID FilmArray® test applied to LBAs, and at what price. Cost-benefit studies will have to be carried out to evaluate it. |
| Langue de rédaction | Français |
| Nb pages | 47 |
| Diplôme | Diplôme d'État de docteur en pharmacie |
| Date de soutenance | 2018-10-05 |
| Editeur | Université Angers |
| Place Published | Angers |
| Libellé UFR | UFR de Sciences Pharmaceutiques et d'Ingénierie de la Santé |
| Numéro national | 2018ANGE070P |