L’équipe « Stratégies Infectieuses des Xanthomonas » (SIX) effectue de la recherche fondamentale sur pouvoir pathogène de Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc) et l’immunité de ses plantes hôtes, les Brassicacées. Mon projet porte sur l’étude d’une famille d’effecteurs de type III (ET3) spécifique des bactéries du genre Xanthomonas, les TALEs (Transcription-Activator Like Effectors), et leur contribution à la virulence. Après translocation dans le noyau des cellules végétales, ces effecteurs fonctionnent comme des facteurs de transcription induisant l’expression de gènes de sensibilité favorisant la maladie. Un outil de suivi de la translocation des effecteurs a été développé dans l’équipe. Il est basé sur la transactivation d’un gène rapporteur (GUS) dans la plante hôte par un TALE artificiel exprimé par Xcc. Les travaux réalisés au cours de ce stage ont permis de visualiser la translocation du TALE artificiel dans les hydathodes et le système vasculaire de la plante au cours de l’infection. Cet outil devrait également permettre par la suite d’identifier de nouveaux ET3. En parallèle, des tests du pouvoir pathogène m’ont permis de montrer que le TAL12a de Xcc CN08 est important pour la virulence de Xcc sur Brassica oleracea var. botrytis cv. Clovis. Des données de transcriptomiques, générées par séquençage des ARN de plusieurs Brassicacées inoculées avec une souche de Xcc exprimant TAL12a, m’ont permis d’établir une liste restreinte de gènes dont l’expression est induite par TAL12a. Le croisement de ces données avec la liste des promoteurs possédant une boîte de fixation de TAL12a devrait permettre l’identification de gènes de sensibilité candidats activés par TAL12a.
The team “Xanthomonas infectious strategies” (SIX) is conducting fundamental research on Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc) pathogenicity and on immunity of hosts plant, the Brassicaceae. My project is to study a type III effectors (T3E) family characteristic of Xanthomonas bacteria genus, the TALEs (Transcription-Activator Like Effectors), and their effect on virulence. Once translocated into plant cell nuclei, these effectors act as transcription factors inducing expression of susceptibility genes and promoting disease. The team has engineered a tool to try and visualized in wivh celles T3E are translocated. It is based on the transactivation of a reporter gene (GUS) in the host plant by an artificial TALE delivered by Xcc. The work conducted during this internship has allowed to visualised the artificial TALE translocation in hydathodes and the vascular system of the plant during infection. This tool should also allow us to identify new T3E in the future. In parallel, I showed using pathogenicity assays that TAL12a of strain Xcc CN08 is important for the virulence of Xcc on Brassica oleracea var. botrytis cv. Clovis. Based on transcriptomic data produced by RNA sequencing of several Brassicaceae inoculated with Xcc strain expressing TAL12a, I was able to define a limited set of genes which expression is induced by TAL12a. Crossing these data with the list of promotors containing TAL12a fixation box should allow the identification of candidate susceptibility genes activated by TAL12a.