Caractérisation moléculaire des gliomes diffus du tronc cérébral de l'enfant - PPM1D comme nouvel outil de classification ?
| Titre | Caractérisation moléculaire des gliomes diffus du tronc cérébral de l'enfant - PPM1D comme nouvel outil de classification ? |
| Type | Thèse d'exercice : Médecine |
| Auteurs | El Ayoubi Rida |
| Directeurs | Rousseau Audrey |
| Année | 2017 |
| URL | http://dune.univ-angers.fr/fichiers/20126868/2017MDEAN6842/fichier/6842F.pdf |
| Mots-clés | DIPG, Gliome diffus, Gliome diffus intrinsèque du pont, Histones H3, pédiatrie, PPM1D, TP53, Tronc cérébral |
| Résumé | Introduction : les gliomes diffus du tronc cérébral de l’enfant, couramment dénommés « gliomes diffus intrinsèques du pont » (DIPG, diffuse intrinsic pontine glioma) constituent un challenge neuro-oncologique du fait de leur localisation anatomique difficilement accessible. Des caractéristiques génétiques et épigénétiques propres aux gliomes diffus de l’enfant ont récemment été identifiées. Les gènes TP53 et PPM1D semblent être mutés selon un mode mutuellement exclusif. L’objectif principal de l’étude était de déterminer le statut mutationnel du gène PPM1D dans une cohorte de DIPG diagnostiqués au CHU d’Angers. L’existence de deux sous-groupes de DIPG selon le statut mutationnel PPM1D/TP53 permettrait d’affiner la classification de ces tumeurs. Matériel et Méthodes : 22 cas ont été sélectionnés. Une étude immunohistochimique (IHC) contre les antigènes suivants a été réalisée : H3K27me3, ATRX, p53, IDH1-R132H, BRAF-V600E et Ki-67. Un séquençage Sanger a porté sur les gènes PPM1D, HIST1H3B, H3F3A, ACVR1, IDH1/2 et BRAF. Enfin, une analyse pangénomique par SNP array a été réalisée. Résultats : en IHC, il existait une perte partielle ou complète de H3K27me3 dans 18 cas (sur 18 cas testés, 100%) et une surexpression de p53 dans 13 cas (sur 21 cas testés, 62%). L’IHC a mis en évidence une mutation BRAF-V600E dans un cas. Une mutation PPM1D a été identifiée dans 2 cas (9%) porteur d’une mutation H3.3K27M sans mutation TP53. Aucun cas avec mutation TP53 ne présentait de mutation PPM1D. Le caractère mutuellement exclusif des mutations PPM1D et TP53 était statistiquement significatif (p = 0,048, test exact de Fisher). Nous avons mis en évidence une mutation H3K27M dans tous les cas de la cohorte sauf un. Une mutation BRAF-V600E, confirmée en séquençage Sanger, n’a jamais été décrite dans les DIPG. Les profils pangénomiques par SNP array ont montré une atteinte fréquente des bras chromosomiques 1q (gain), 5q (perte), 10q (perte) et 17p (perte). ; un cas présentait une LOH à copie neutre du chromosome 17p, non encore rapportée dans les DIPG. Conclusion : les mutations des gènes TP53 et PPM1D, intervenant sur la même voie de signalisation, sont mutuellement exclusives. Cette dichotomie permet d’affiner la classification des DIPG et pourra potentiellement aider à stratifier les patients dans des essais thérapeutiques anti-PPM1D. |
| Résumé en anglais | Introduction : pediatric diffuse brainstem gliomas, commonly called « diffuse intrinsic pontine glioma » (DIPG), represent a neuro-oncologic challenge owing to their surgically inaccessible anatomic location. Unique genetic and epigenetic features of pediatric diffuse gliomas have recently been identified. TP53 and PPM1D genes seem to be mutated in a mutually exclusive manner. The main objective of this study was to assess the mutational status of PPM1D gene in a DIPG cohort diagnosed at Angers University Hospital. The identification of two DIPG subgroups according to the PPM1D/TP53 mutational status would help refine the classification of these tumors. Material and Methods : 22 cases were selected. Immunohistochemistry (IHC) against the following antigens was performed: H3K27me3, ATRX, p53, IDH1-R132H, BRAF-V600E, and Ki-67. Sanger sequencing of PPM1D, HIST1H3B, H3F3A, ACVR1, IDH1/2 and BRAF genes was carried out. Lastly, a pangenomic SNP array analysis was performed. Results : IHC showed partial or total loss of H3K27me3 in 18 cases (out of 18 tested, 100%) and p53 accumulation in 13 mutation, validated by Sanger sequencing, has never been described in DIPG. Pangenomic SNP arrays showed imbalanced genomes; one case displayed a copy neutral LOH on 17p, never reported before in DIPG. Conclusion : TP53 and PPM1D mutations are mutually exclusive in DIPG underlining their roles in the same signaling pathway. This dichotomy allows refining the classification of DIPG. The prognostic value of PPM1D mutation has yet to be defined. In the future, PPM1D status may help stratify patients in clinical trials targeting this oncogene. |
| Langue de rédaction | Français |
| Nb pages | 73 |
| Diplôme | Diplôme d'État de docteur en médecine |
| Date de soutenance | 2017-03-16 |
| Editeur | Université Angers |
| Place Published | Angers |
| Libellé UFR | UFR Médecine |
| Numéro national | 2017ANGE206M |