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Rôle de TAL18H dans l'interaction haricot/Xanthomonas

Année
2016
Mots clés
Résumé en français

La graisse commune du haricot causée par Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli est l’une des bactérioses la plus dévastatrice sur haricot (Phaseolus vulgaris). La virulence de ces bactéries est principalement dû à des effecteurs TALs, sécrétés de façon intracellulaire chez la plante, via un système de sécrétion de type III. Ces protéines sont capables de se comporter comme des facteurs de transcription en activant spécifiquement la transcription de gènes chez la plantes. Il est donc essentiel de mieux comprendre le fonctionnement de ces effecteurs, et de mieux connaître leur cible, pour lutter efficacement contre la graisse commune. Dans cette étude, nous avons étudié l’effecteur TAL18H présent dans la souche CFPB-6546R. Pour ce faire, nous avons utilisé la bactérie sauvage CFBP-6536R et son mutant CFBP-6546RΔtal18H sur deux variétés divergentes de haricots : BAT93 et JaloEEP558. Des tests de pouvoir pathogène sur plante ont été effectués de façon à montrer des différences de sensibilité entre les deux variétés ainsi que l’implication de TAL18H dans l’interaction pharicot/Xanthomonas. Des qPCR sur des gènes potentiellement ciblés par cet effecteur ont également été réalisé pour trouver des cibles de ce TALE. Nous avons alors montré que la variété JaloEEP558 était plus sensible que la variété BAT93. Nous avons également confirmé le rôle de TAL18H dans l’agressivité de CFBP-6546R. Enfin, le transcrit issu de la région génomique Phvul.009G_21754051..21753702 a montré une surexpression en présence de TAL18H. Cette région génomique présente des caractéristiques qui suggèrent qu’il s’agit d’un micro-ARN, ce qui serait le premier micro-ARN jamais démontré comme cible d’un TALE.

Résumé en anglais

Common bacterial blight of bean caused by Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli is the most devastating disease on bean (Phaseolus vulgaris). The virulence of this bacterium is mainly due to TAL effectors, which are secreted inside the plant cell via the type III secretion system. This protein act as a transcription factor by activating the transcription of specific plant genes. It is therefore essential to better understand the function of these effectors, and to know more about their targets to improve the management of common bacterial blight. In this study, we studied the role of TAL18H in strain CFBP-6546R. To do this, we have inoculated the wild-type bacteria CFBP-6546R and its mutant CFBP-6546RΔtal18H on two divergent varieties of bean : BAT93 and JaloEEP558. A pathogenicity test was conducted to show difference of susceptibility between the two variety and the involvement of TAL18H in the bean/Xanthomonas interaction. qPCRs on putative TAL18H targeted genes were made in order to find targets of this TALE. We have shown that JaloEEP558 was more susceptible than BAT93. We also confirmed the role of TAL18H in the virulence of CFBP-6546R. Finally, the transcript from the genomic region Phvul.009G_21754051..21753702 showed an overexpression in the presence of TAL18H. This genomic region has characteristics similar to miRNA, which until now had never been described as TALE targets.

Nombre de pages
20
Année de soutenance
2016-06-27
Type de dépôt
Mémoire de Master
Langue de publication
Français
Éditeur
Université Angers
Lieu d'édition
Angers
Citation Key
dune5974
URL
http://dune.univ-angers.fr/fichiers/15005571/20163MABTV5974/fichier/5974F.pdf
Mémoire
Libellé de l'UFR
UFR de Sciences
Libellé du diplôme
Master Biologie Végétale
Libellé de l'étape
M1 Biologie et technologie du végétal
Bac+
4
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