Mise au point d'un test de détection commun pour Phoma valerianellae et Peronospora valerianellae par grow-out
| Titre | Mise au point d'un test de détection commun pour Phoma valerianellae et Peronospora valerianellae par grow-out |
| Type | Rapport de stage |
| Auteurs | Aere Kevin |
| Directeurs | Poupard Pascal |
| Année | 2015 |
| URL | http://dune.univ-angers.fr/fichiers/14004832/20153MABTV4387/fichier/4387F.pdf |
| Mots-clés | analyses sanitaires, champignons, grow-out, ISHI, pathologie, Peronospora valerianellae, Phoma valerianellae, protocoles, SNES |
| Résumé | Dans une volonté d'amélioration et de standardisation de méthodes d'analyses, des instances internationales, telles que l'ISTA (International Seed Testing Association) ou l'ISHI (International Seed Health Institute), chargent des laboratoires de mettre au point ou d'améliorer des méthodes d'analyses. C'est dans ce cadre ci, sous une demande de l'ISHI, que ce stage au sein du laboratoire de pathologie de la SNES s'inscrit. Sur mâche (Valerianella locusta), depuis quelques années, deux champignons provoquent de grands dégâts en culture : Phoma valerianellae et Peronospora valerianellae. Ces deux champignons sont relativement bien caractérisés en laboratoires et des méthodes d'identification et d'analyses sanitaires existent pour chacun d'entre eux. La mission attribuée par l'ISHI est ici de travailler à la mise au point d'un test de détection commun pour Phoma valerianellae et Peronospora valerianellae par grow-out. Différents protocoles sont mis en place, en faisant varier les températures, l'éclairement et les substrats utilisés, pour tester à partir de lots contaminés les résultats obtenus. Les taux de contamination obtenus sont confrontés à ceux fournis par les semenciers hollandais et ceux préalablement obtenus au sein du laboratoire. Au vu des résultats obtenus, il a été mis en évidence l'importance majeure des différents paramètres environnementaux dans la détection des deux pathogènes. Aucun protocole testé n'a permis de détecter à la fois Phoma valerianellae et Peronospora valerianellae de manière optimale. Un problème de répétabilité a également été mis en évidence au cours des différents pré-tests réalisés et après comparaison des résultats obtenus chez les semenciers. En conclusion, il semble difficile de trouver des conditions climatiques identiques permettant la détection des deux agents pathogènes Phoma et Peronospora valerianellae simultanément. De nouveaux essais méthodologiques devront être appliqués afin de pallier aux problèmes rencontrés. |
| Résumé en anglais | In an aim of amelioration and standardization of analytical methods, international institutes, such as ISTA (International Seed Testing Association) or ISHI (International Seed Health Institute), ask laboratories to create or improve analytical methods. It is in this order, under ISHI authority, that this internship at the SNES pathology's laboratory is taking place. Corn salad crops (Valerianella locusta), for few years, are heavily damaged by two fungis : Phoma valerianellae and Peronospora valerianellae. These two fungis are relatively well characterized in laboratories and their identification and seed health testing methods are known for each one. The ISHI's ordreal here is to work on the creation of a common detection test for both Phoma valerianellae et Peronospora valerianellae by grow-out. Several protocols are tested, with temperature, light and substract variation, to analyze the results using contaminated seed lots. Contamination rates obtained are analyzed against those obtained by the dutch seed producers, and those previously obtained in the laboratory. In the sight of the obtained results, it has been shown the major importance of the different environmental parameters in the detection of these two pathogens. No tested protocol allowed the detection of both Phoma valerianellae et Peronospora valerianellae at the same time in an optimal way. A repeatability problem has also been put in evidence during these tests and after confrontation with seed producers results. In the end, it seems quite complicated to find similar climate conditions allowing the detection of both Phoma et Peronospora valerianellae simultaneously. New methodological tests must be run to pass over the problems encountered |
| Langue de rédaction | Français |
| Nb pages | 19 |
| Diplôme | Master Biologie Végétale |
| Date de soutenance | 2015-06-30 |
| Editeur | Université Angers |
| Place Published | Angers |
| Entreprise | GEVES |
| Tuteur | Poupard, Pascal |
| Libellé UFR | UFR de Sciences |