Création d'une base de données spécifique des mutations OPA1 pour l'analyse des corrélations génotype-phénotype dans l'atrophie optique dominante

TitreCréation d'une base de données spécifique des mutations OPA1 pour l'analyse des corrélations génotype-phénotype dans l'atrophie optique dominante
TypeThèse d'exercice : Médecine
AuteursCaignard Angélique
DirecteursMilea Dan
Année2014
URLhttp://dune.univ-angers.fr/fichiers/20096946/2014MDEOP2519/fichier/2519F.pdf
Mots-clésatrophie optique dominante (AOD), Locus-specific database (LSDB), optic atrophy 1 (OPA1)
Résumé

Introduction : l’atrophie optique dominante (AOD) est une neuropathie optique dégénérative caractérisée par une baisse d’acuité visuelle bilatérale progressive, avec une prévalence de 1/30 000. Parmi les AOD, 50-60 % sont associées à une mutation du gène OPA1.La présentation phénotypique des patients porteurs de la mutation OPA1 est hétérogène ; chez environ 20 % des patients il existe des symptômes extra oculaires. Le but de ce travail est de créer une base de données publique, accessible sur Internet, pour recenser les manifestations phénotypiques associées aux mutations du gène OPA1.
Matériel et méthodes : nous avons conçu une base de données spécifique (Locus-specific database, LSDB) du locus OPA1, en utilisant le logiciel Leiden Open-Source Variation Database (LOVD). Elle permet d’enregistrer de façon anonyme la description clinique et moléculaire détaillée d'un patient, à laquelle seront rattachés un ou plusieurs variants. La description clinique est standardisée grâce à un formulaire web, comprenant 31 items cliniques/paracliniques dont 26 items ophtalmologiques.
Résultats : notre LSBD répertorie à ce jour 302 variants pathogènes et non pathogènes du gène OPA1. Les données cliniques ophtalmologiques recueillies regroupent l’acuité visuelle, le fond d’œil, l’atteinte du nerf optique et le handicap visuel. Les autres informations concernent les modes de vie et les éventuelles atteintes neurologiques ou auditives associées.
Conclusion : notre LSBD OPA1 de mitodyn.org., seule initiative de ce type à ce jour, devrait permettre une description exhaustive des mutations génétiques et des manifestations cliniques de l'AOD, afin d'affiner les corrélations génotypes-phénotypes dans les AOD.
Résumé en anglais

Introduction : autosomal dominant optic atrophy (ADOA; MIM# 165500) is a genetically determined optic neuropathy characterized by a progressive bilateral decrease of visual acuity. Mutations in the optic atrophy 1 gene (OPA1; MIM# 605290) are responsible for about 60–80% of the cases of ADOA. The phenotypic presentations of patients carrying OPA1 mutations are heterogeneous, and genotype-phenotype correlations are difficult to infer. Our objective in this project was to develop a clinicobiological database to characterize the spectrum of clinical phenotypes due to OPA1 mutations.
Methods and Results : we have established a locus-specific database for OPA1 using the Leiden Open-source Variation Database (LOVD). Contributors can submit a clinical and molecular description online, with respect of anonymous of the patient. A standardized description of the 31 clinical items and 26 molecular items is set up using drop-down lists with predefined variables
To date, the OPA1 database contains 302 unique variants, and offers the possibility of a detailed description of the ophthalmological data of the patients including mean retinal nerve fiber layer (RNFL) and mean ganglion cell layer (GCL) thickness, as measured with optical coherence tomography (OCT). Features of hearing loss and neurological symptoms can also be recorded. As a test we have already successfully registered about 20 patients with full clinical data from our institution.
Conclusion : larger submissions to the OPA1 LSDB, which is part of the mitodyn.org (portal of database of genes incriminated in disorders involving mitochondrial dynamics), will allow a comprehensive analysis to address genotype-phenotype correlations.
Langue de rédactionFrançais et Anglais
Nb pages35
Diplôme

Diplôme d'État de docteur en médecine
Date de soutenance2014-06-23
EditeurUniversité Angers
Place PublishedAngers
Libellé UFR

UFR Médecine
Numéro national2014ANGE078M