Chez les plantes, les éléments transposables (ETs) représentent une part importante des génomes et pourraient jouer un rôle clé dans l’évolution et la diversification des espèces. Le pommier (Malus domestica) et le poirier (Pyrus communis), deux espèces proches de la famille des Rosacées, présentent des différences phénotypiques importante malgré leur proximité évolutive. Ce stage avait pour objectif de déterminer si les ETs ont pu jouer un rôle dans la différenciation entre ces deux espèces, notamment en relation avec le burst d’ETs supposé il y a 21 millions d’années. Pour cela, une analyse comparative de la synténie génique entre le pommier et le poirier a été réalisée, couplée à l’étude de la répartition des ETs dans ces régions conservées. L’objectif était d’identifier les ETs présents dans les régions homologues entre les deux espèces, afin d’évaluer leur distribution et leur éventuel lien avec la dynamique des blocs synténiques. Ce travail constitue une première étape vers une meilleure compréhension du rôle potentiel des ETs dans l’évolution différentielle de ces deux espèces fruitières, et ouvre des perspectives pour des analyses plus ciblées sur certaines familles d’ETs ou sur les conséquences fonctionnelles de leurs insertions.
In plants, transposable elements (TEs) represent a major part of genomes and may play a key role in the evolution and diversification of species. The apple (Malus domestica) and the pear (Pyrus communis), two closely related species of the Rosaceae family, exhibit significant phenotypic differences despite their evolutionary proximity. This project aimed to investigate whether TEs could have contributed to the divergence between these two species, particularly in relation to the TE burst hypothesized to have occurred around 21 million years ago. To this end, a comparative analysis of gene synteny between apple and pear was carried out, combined with an investigation of the distribution of transposable elements (TEs) within these conserved regions. The objective was to identify the TEs present in homologous regions between the two species, in order to assess their distribution and potential link with syntenic block dynamics. This work represents a first step toward a better understanding of the potential role of TEs in the differential evolution of these two fruit species, and opens up perspectives for more targeted analyses on specific TE families or the functional consequences of their insertions.