Impact of the SARS-CoV2 pandemic on the acquisition of extended-spectrum beta-lactamaseproducing Enterobacteriaceae in a medical intensive care unit
| Titre | Impact of the SARS-CoV2 pandemic on the acquisition of extended-spectrum beta-lactamaseproducing Enterobacteriaceae in a medical intensive care unit |
| Type | Thèse d'exercice : Médecine |
| Auteurs | Taillantou-Candau Mathilde |
| Directeurs | Mahieu Rafaël |
| Année | 2023 |
| URL | https://dune.univ-angers.fr/fichiers/18013052/2023MCEM17463/fichier/17463F.pdf |
| Mots-clés | acquisition, Covid-19, Extended-spectrum beta-lactamase-producing Enterobacteriaceae, Intensive care unit. |
| Résumé | Introduction : la pandémie de SARS-CoV2 a été associée à d’importants changements en terme de prise en charge des patients, notamment concernant les procédures d’hygiène. Les mesures de prévention associées à la prise en charge de patients porteurs d’infections à COVID-19 ont pu limiter le risque d’acquisition de bactéries multi-résistantes, alors qu’une charge en soin majorée ainsi qu’une augmentation de consommation d’antibiotiques ont pu être associées à un risque majoré d’acquisition de bactéries multi-résistantes. Méthodes : nous avons comparé rétrospectivement le taux d’acquisition d’entérobactéries productrices d’une bêta-lactamase à spectre élargi (BLSE) entre la période pré-COVID et la période COVID dans un service de réanimation médicale. Résultats : entre 2018 et 2022, 1736 patients âgés en moyenne de 64 [49 – 79] ans ont été inclus. Bien que le score SOFA à l'admission ne diffère pas entre les deux périodes, la durée de séjour était plus élevée pendant la période COVID par rapport à la période pré-COVID (18,90 jours vs. 13,70 jours respectivement, p < 0,001), avec plus de patients recevant une ventilation mécanique pendant la période COVID (81% vs. 73%, p < 0,001) pour une durée plus longue (16,5 vs. 9,8 jours, p < 0,001). Le taux d'acquisition de BLSE était plus élevé pendant la période COVID par rapport à la période pré-COVID (14 % [IC95 11,6 - 16,7] contre 8,9 % [IC95 7,1 - 11,0] respectivement, p=0,001), avec un délai plus long entre l'admission en réanimation et l'acquisition de BLSE (14 contre 10 jours, =0,003), alors que le taux de porteurs de BLSE à l'admission n'était pas significativement différent (6 % contre 8 %, P=0,57, respectivement). Au cours de la période COVID, on a observé une diminution significative de l'utilisation globale des antibiotiques, avec une augmentation de l'utilisation des carbapénèmes et de pipéracilline-tazobactam et une diminution de l'utilisation d'amoxicilline, d'amoxicilline-acide clavulanique et des céphalosporines de 3ième génération. Dans l'analyse multivariée, la ventilation mécanique de plus de 10 jours, l'hémodialyse et la durée du séjour étaient significativement associées à l'acquisition de BLSE en réanimation. La ventilation non invasive et l'utilisation de fluoroquinolones étaient négativement associées à l'acquisition de BLSE. Conclusion : dans notre réanimation, le taux d'acquisition de BLSE était plus élevé pendant la période COVID. Dans le modèle multi-états, le score SOFA à l'admission était le seul facteur de risque d'acquisition de BLSE. D'autres études sont nécessaires pour évaluer si le taux d'acquisition de BLSE a diminué après la période COVID. |
| Résumé en anglais | Background : the SARS-CoV2 pandemic period has been associated with major changes in patients care, in particular for hygiene procedures. COVID-19 prevention procedures may have limited the risk of multidrug resistant bacteria acquisition whereas a high degree of nursing workload and increase in antibiotic consumption may be associated with a higher risk of MDR bacteria acquisition. Methods : the extended spectrum beta lactamase (ESBL) Enterobacteriaceae acquisition rate was retrospectively compared between the pre-COVID period and the COVID period in a single intensive care unit (ICU). Results : between January 1, 2018 and December 31, 2022, 1736 patients with a mean age of 64 [49 – 79] years old were included. Although admission sequential organ failure assessment (SOFA) score did not differ between the two periods, the length of stay was higher during the COVID period compared to the pre-COVID period (18.90 days vs. 13.70 days respectively, p < 0.001), with more patients receiving mechanical ventilation during the COVID period (81% vs. 73%, p<0.001) for a longer period of time (16.5 vs. 9.8 days, p< 0.001). The rate of ESBL acquisition was higher during the COVID period than during the pre-COVID period (14% [CI95 11.6 – 16.7] vs. 8.9% [CI95 7.1 – 11.0] respectively, p=0.001), with a longer time from ICU admission to ESBL acquisition (14 vs.10 days, P=0.003),while the rate of ESBL carriers at admission was not significatively different (6% vs. 8%, P=0.57, respectively). During the COVID period, there was a significant decrease in the global use of antibiotics, with an increased use of carbapenems and piperacillin-tazobactam and a decreased use of amoxicillin, amoxicillinclavulanic acid, and third generation cephalosporins. In the multivariate analysis, mechanical ventilation more than 10 days, hemodialysis and length of stay was significantly associated with ESBL acquisition in ICU. Noninvasive ventilation and fluoroquinolone use were negatively associated with ESBL acquisition. Conclusions : in our ICU, the rate of ESBL acquisition was higher during the COVID period. In the multivariate analysis, length of stay, mechanical ventilation more than 10 days and hemodialysis were associated with ESBL acquisition. Further studies are needed to evaluate whether the rate of ESBL acquisition decreased after the COVID period. |
| Langue de rédaction | Français |
| Nb pages | 58 |
| Diplôme | Diplôme d'État de docteur en médecine |
| Date de soutenance | 2023-10-25 |
| Editeur | Université Angers |
| Place Published | Angers |
| Libellé UFR | UFR Médecine |
| Numéro national | 2023ANGE176M |