L’océan abrite une variété d'espèces, dont les phytoplanctons, éléments fondamentaux de la chaîne alimentaire marine. Des études récentes portant sur ces microorganismes ont engendré le développement de technologies d'imagerie facilitant leur échantillonnage. Dans ce travail, je présente le PlanktoScope, une plateforme modulaire et open-source qui permet une imagerie quantitative des microorganismes marins. Son atout majeur réside dans un système optique inspiré du microscope standard. Ce travail de mémoire se focalise sur l'exploration de techniques d'imagerie microscopique adaptables au PlanktoScope, visant à améliorer sa capacité de discrimination. Il a été sans complexe démontré que malgré ses dimensions compactes, le PlanktoScope peut être transformé en microscope en champ sombre, permettant l'observation d'échantillons transparents. De plus, il peut fonctionner en tant que système d'imagerie CTIS, offrant un accès aux données spectrales des échantillons. De même, la configuration en microscope polarisant révèle la nature anisotrope des échantillons. Cependant, la mise en œuvre de la microscopie à fluorescence sur le PlanktoScope demeure un défi. Les contraintes de taille rendent complexe la mise en place d'un système d'éclairage optimal. Ainsi, cette technique reste encore difficile à exécuter efficacement sur notre plateforme.
The ocean harbors a diversity of species, including phytoplankton, which serve as fundamental components of the marine food chain. Recent studies focused on these microorganisms have led to the development of imaging technologies that facilitate their sampling. In this study, I introduce the PlanktoScope, a modular and open-source platform enabling quantitative imaging of marine microorganisms. Its primary strength lies in an optical system inspired by the standard microscope. This work concentrates on exploring microscopic imaging techniques adaptable to the PlanktoScope, with the aim of enhancing its discrimination capabilities. It has been convincingly demonstrated that despite its compact dimensions, the PlanktoScope can be converted into a dark-field microscope, enabling the observation of transparent samples. Furthermore, it can function as a CTIS imaging system, providing access to spectral data from the samples. Similarly, the configuration as a polarizing microscope reveals the anisotropic nature of the samples. However, the implementation of fluorescence microscopy on the PlanktoScope remains a challenge. Size constraints complicate the establishment of an optimal lighting system. Consequently, this technique continues to present difficulties in achieving effective execution on our platform.