Le séquençage haut débit de l’ADN pour l’identification des bases moléculaires des pathologies mendéliennes : opportunités et défis
| Titre | Le séquençage haut débit de l’ADN pour l’identification des bases moléculaires des pathologies mendéliennes : opportunités et défis |
| Type | Thèse de doctorat |
| Auteurs | Ziegler Alban |
| Directeurs | Bonneau Dominique, Galibert Marie-Dominique, Bourgeron Thomas, Nicolas Gaël, Dubourg Christèle, Sturtz Franck, Piton Amélie |
| Année | 2022 |
| URL | https://dune.univ-angers.fr/fichiers/20106880/202217006/fichier/17006F.pdf |
| Mots-clés | exome, génome, impasse diagnostique, interprétation, oligogénisme, variants non-codants |
| Résumé | L'avènement du séquençage à haut-débit a révolutionné l’élucidation des bases moléculaires des pathologies mendéliennes, malgré ces avancées près d’une personne sur deux présentant une pathologie suspecte d’être mendélienne reste dans une situation d’impasse diagnostique. La combinaison de progrès pour le séquençage, pour l’interprétation et pour la caractérisation fonctionnelle des variants est à même de surmonter une partie de ces impasses. La prise en compte des limites inhérentes aux approches utilisées (cohortes cas/témoins, modèle in vitro ou in vivo) pour élucider les bases moléculaires des pathologies est cruciale pour adopter des stratégies de recherche efficaces. L’interprétation des variants non-codants et la confirmation de pathologies oligogéniques s’annoncent comme des défis majeurs à surmonter et plaident pour le renforcement des collaborations internationales et interdisciplinaires. L’élucidation des bases moléculaires des pathologies devient d’autant plus importante que le développement de thérapies ciblées innovantes permet d’orienter la prise en charge thérapeutique en fonction des bases moléculaires. |
| Résumé en anglais | The advent of high-throughput sequencing revolutionized the elucidation of the molecular basis of Mendelian diseases. However, nearly one out of two people with a suspected Mendelian disease remains without diagnosis. The combination of progress in sequencing, interpretation and functional characterization of variants can overcome some of these diagnostic odysseys. Considering the inherent limitations of the methods (case/control cohorts, in vitro or in vivo model) used to elucidate the molecular basis of pathologies is key to define successful research strategy. The interpretation of non-coding variants and the confirmation of oligogenic diseases are major challenges to be overcome and plead for the strengthening of international and interdisciplinary collaborations. The elucidation of the molecular basis of genetic diseases becomes even more important as the implementation of innovative targeted therapies relies on a good understanding of these molecular basis |
| Langue de rédaction | Français |
| Diplôme | Thèse de doctorat |
| Date de soutenance | 2022-12-14 |
| Editeur | Université d'Angers |
| Place Published | Angers |
| Libellé UFR | Collège doctoral |
| personnalisé5 | École doctorale Biologie-Santé (Nantes) |
| personnalisé6 | Mitovasc (Angers) |
| personnalisé7 | Génétique, Génomique, Bioinformatique |