Caractérisation de la sensibilité de mutants de peptides sécrétés : phénotypage de la résistance d’Arabidopsis thaliana au champignon nécrotrophe Alternaria brassicicola chez des mutants de peptides de plante identifiés par transcriptomique
| Titre | Caractérisation de la sensibilité de mutants de peptides sécrétés : phénotypage de la résistance d’Arabidopsis thaliana au champignon nécrotrophe Alternaria brassicicola chez des mutants de peptides de plante identifiés par transcriptomique |
| Type | Rapport de stage |
| Auteurs | Goupille Valentin |
| Directeurs | Veronesi Christophe |
| Année | 2023 |
| URL | https://dune.univ-angers.fr/fichiers/19004853/2023TMBV16932/fichier/16932F.pdf |
| Mots-clés | Alternaria brassicicola, Arabidopsis thaliana, croissance, défense, génétique fonctionnelle, peptides sécrétés |
| Résumé | Les plantes ont développé des mécanismes de régulation complexes et spécifiques pour favoriser leur développement, leur croissance et leur défense face aux agressions extérieures. Parmi eux, les phytocytokines sont de petits peptides de signalisation sécrétés, connus pour participer à la régulation de ces différents processus. Dans le cadre du projet ANR STRESS-PEPT nous nous sommes focalisés sur l'identification et le rôle des peptides sécrétés par Arabidopsis thaliana dans son interaction avec le champignon nécrotrophe Alternaria brassicicola. L'étude s'est concentrée sur 12 mutants d'Arabidopsis thaliana affectés dans l'activité de 8 gènes codant pour des peptides sécrétés sélectionnés par analyse RNAseq. Le présent travail a permis de montrer qu’au stade post-germinatif, 7 des 8 gènes étudiés étaient impliqués dans la sensibilité de la plante à l'infection par Alternaria brassicicola. Certains de ces gènes étaient également liés à la capacité germinative. Au stade rosette, une méthode de quantification des symptômes et de la surface foliaire a été développée. Les résultats ont suggéré que les mutations de certains gènes affectaient la croissance de la plante. L'analyse des symptômes des nécroses est en cours pour comprendre l'implication des peptides dans l'interaction entre A. thaliana et A. brassicicola. Les résultats obtenus fournissent des bases pour des recherches approfondies sur l'implication des peptides sécrétés à différents stades de développement. Ces peptides à la frontière des voies de défenses et du développement ouvrent des pistes vers de nouvelles stratégies d’amélioration variétales considérant conjointement ces deux aspects. Ce travail sera à terme source d’innovation pour des approches de biocontrôle. |
| Résumé en anglais | Plants have developed complex and specific regulatory mechanisms to promote their development, growth, and defense against external threats. Among them, phytocytokines are small secreted signaling peptides known to participate in the regulation of these various processes. Within the framework of the ANR STRESS-PEPT project, we focused on the identification and role of peptides secreted by Arabidopsis thaliana in its interaction with the necrotrophic fungus Alternaria brassicicola. The study focused on 12 mutants of Arabidopsis thaliana affected in the activity of 8 genes encoding secreted peptides selected through RNAseq analysis. This work has shown that, at the post-germinative stage, 7 out of the 8 genes studied were involved in the plant's susceptibility to infection by Alternaria brassicicola. Some of these genes were also linked to germinative capacity. At the rosette stage, a method for quantifying symptoms and leaf area was developed. The results suggested that mutations in certain genes affected plant growth. Analysis of necrotic symptom is ongoing to understand the involvement of peptides in the interaction between A. thaliana and A. brassicicola. The obtained results provide a basis for in-depth research on the involvement of secreted peptides at different stages of development. These peptides, at the crossroads of defense pathways and development, open up avenues for new plant breeding strategies that consider both aspects simultaneously. Ultimately, this work will be a source of innovation for biocontrol approaches. |
| Langue de rédaction | Français |
| Nb pages | 20 |
| Diplôme | Master Biologie Végétale |
| Date de soutenance | 2023-07-07 |
| Editeur | Université Angers |
| Place Published | Angers |
| Entreprise | IRHS |
| Tuteur | Véronési Christophe |
| Libellé UFR | UFR de Sciences |