Mise au point sur les méthodes de diagnostic rapide dans les bactériémies : intérêt dans la pratique
| Titre | Mise au point sur les méthodes de diagnostic rapide dans les bactériémies : intérêt dans la pratique |
| Type | Thèse d'exercice : Pharmacie |
| Auteurs | Donnars Anne |
| Directeurs | Eveillard Matthieu |
| Année | 2022 |
| URL | https://dune.univ-angers.fr/fichiers/20132822/2022PDEBM16044/fichier/16044F.pdf |
| Mots-clés | antibiothérapie, bactériémie, Diagnostic rapide, PCR |
| Résumé | Les bactériémies sont des infections graves qui peuvent rapidement mettre en jeu le pronostic vital. Elles nécessitent un diagnostic, une documentation microbiologique et une prise en charge rapide. A ce titre, les méthodes de diagnostic en microbiologie sont en constante évolution et des méthodes de diagnostic rapide ont été développées. L’objectif principal de ce travail a été de réaliser une revue récente de la littérature sur les méthodes de diagnostic rapide des bactériémies et d’évaluer l’intérêt de leur utilisation dans la pratique. Une étude évaluant l’intérêt de la solution diagnostique BCID2® (bioMérieux) pour la réduction des délais nécessaires pour l’initiation ou l’adaptation d’une antibiothérapie dans la prise en charge des bactériémies a été présentée à titre d’illustration dans un second temps. Ces méthodes de diagnostic rapide permettent de raccourcir le délai d’obtention de l’identification lorsque les conditions d’utilisation optimale sont respectées mais sont, pour la plupart, limitées par la nécessité de passer par une étape d’enrichissement en flacon d’hémoculture. Le panel restreint, l’absence d’exhaustivité et les problèmes de sensibilité parfois rencontrés ne permettent pas pour le moment de se passer de l’identification par les méthodes conventionnelles après culture. Finalement si la capacité de ces tests à donner une identification plus rapide et des indications sur l’adaptation du traitement est démontrée dans plusieurs études, l’effet sur le patient (durée de séjour, mortalité) reste généralement peu démontré. Si cette technologie n’est pas parfaite à l’heure actuelle, les perspectives sont multiples: amélioration des technologies déjà commercialisées, séquençage haut-débit, intelligence artificielle, antibiogramme accéléré... Les avancées des 10 à 20 dernières années comme l’identification par spectrométrie de masse, la robotisation de l’ensemencement, l’incubation et l’arrivée de la biologie moléculaire ont changé la manière d’envisager la microbiologie. Le séquençage à haut débit et l’intelligence artificielle pourraient encore faire évoluer cette discipline et en particulier la prise en charge des bactériémies dans un futur proche. |
| Résumé en anglais | Bloodstream infections are very serious and life-threatening conditions. They need to be diagnosed, microbiologically documented and treated rapidly. For this reason, microbiological diagnosis methods evolve constantly and rapid diagnosis methods have been developed. The main objective of this work was to propose a recent literature review about this method in blood stream infections in order to asses there utility in daily use. An evaluation study of the BCID2® panel (bioMerieux) at Angers University Hospital about identification delay and antimicrobial therapy stewardship delay in bloodstream infections was secondly presented. Rapid diagnostic methods allow decreasing the time necessary for bacterial identification when optimal using conditions are gathered but for most of them, the necessity for enrichment through blood-culture is a limit. Low target number, lack of exhaustiveness and sensitivity issue sometime encountered do not allowed stopping bacterial identification by conventional methods after culture. Finally, if several studies asses the usefulness of these tests in decreasing time to identification, the effects on patient outcome (length of stay, mortality) are still sparsely established. These tests are not perfect currently but perspectives are interesting: improvement of actual methods, next generation sequencing and artificial intelligence, accelerated susceptibility testing, ... Recent advances have already modified the panel of microbiological methods with mass spectrometry identification, robotization and molecular biology breakthrough. Next generation sequencing and artificial intelligence could potentially revolutionize microbiology and particularly the management of bloodstream infections in the future. |
| Langue de rédaction | Français |
| Nb pages | 90 |
| Diplôme | diplôme d'État de docteur en pharmacie |
| Date de soutenance | 2022-10-27 |
| Editeur | Université d'Angers |
| Place Published | Angers |
| Libellé UFR | UFR de Sciences Pharmaceutiques et d'Ingénierie de la Santé |
| Numéro national | 2022ANGE077P |