Les communautés biologiques sont composées d’organismes en réelle ou potentielle interaction. Elles résultent d’événements qui relèvent de l’histoire et peuvent également résulter de mécanismes écologiques et évolutifs. En ce qui concerne les mécanismes écologiques, les espèces d’une communauté donnée sont susceptibles de répondre à diverses interactions écologiques. De plus, elles peuvent également répondre aux facteurs environnementaux abiotiques, tels que les gradients environnementaux de climat, de sol et de végétation. Par conséquent, le principal objectif de ma thèse était de comprendre comment différents gradients environnementaux peuvent modeler les communautés biologiques en utilisant deux types de gradients environnementaux : (i) diversité latitudinale et (ii) intensification de l’utilisation des terres (la perte de végétation native). Dans le premier chapitre, j’ai étudié comment les patrons phylogénétiques des communautés végétales, des métazoaires et des microorganismes diffèrent entre les régions tropicale et tempérée. Les hypothèses classiques de patrons latitudinaux de diversité ont été discutées et connectées à de possibles mécanismes susceptibles d’avoir généré ces patrons. Dans le second chapitre, j’ai utilisé des métriques taxonomique, fonctionnelle et phylogénétique afin de comprendre comment la perte de végétation native affecte de multiples groupes taxonomiques et identifier les implications pour la conservation. Dans le troisième chapitre, j’ai étudié si la taille corporelle de multiples groupes taxonomiques influence leur réponse à la perte de végétation native, et identifier quels sont les mécanismes écologiques et évolutifs qui les ont modelés.
Biological communities are composed of interacting or potentially interacting organisms. They are the result of events related to history and may also be the result of evolutionary and ecological mechanisms. Regarding ecological mechanisms, species in a given community may respond to different ecological interactions. In addition, they can also respond to the abiotic environment, for example, environmental gradients of climate, soil, vegetation cover. In this sense, the main goal of my thesis was to understand how different environmental gradients may shape biological communities using two types of environmental gradients, (i) latitudinal diversity and (ii) land-use intensification (particularly, native vegetation loss). In the first chapter, I investigated how phylogenetic patterns in plant, metazoan, and microorganisms communities differ between the tropical and temperate regions. I discussed the classical hypotheses of latitudinal patterns of diversity and connected with possible mechanisms that may have generated these patterns. In the second chapter, I used taxonomic, functional and phylogenetic metrics to understand how native vegetation loss affects multiple taxonomic groups and its implications for conservation. In the third chapter, I investigated if the body size of multiple taxonomic groups influences their response to the native vegetation loss and what are ecological, and evolutionary mechanisms that shaped it.