Les graines sont vectrices bactéries bénéfiques, néfastes ou commensaux pour la plante qui contribuent à la santé et au développement de la future plante. Il est nécessaire de comprendre la façon dont ces bactéries se transmettent à la plantule. Cette transmission repose sur une interaction complexe entre les bactéries et la plante, il est dans ce cadre important d’étudier (i) les défenses de la plante qui vont moduler la transmission d’agents microbiens et (ii) les déterminants génétiques qui vont permettre aux microorganismes de se transmettre. Dans ce rapport, nous avons mesuré par qPCR l’expression des défenses des plantules de radis après inoculation sur les semences de Xanthomonas campestris pv. campestris et de bactéries natives du microbiote des graines. Puis nous avons tenté d’identifier les déterminants génétiques bactériens nécessaires à la colonisation de la plantule par une approche Rb-TnSeq. Nous avons pu mettre en évidence que les plantules expriment des défenses lorsqu’elles sont confrontées uniquement au microbiote naturel de la graine. Cependant, la présence d’un pathogène ne semble globalement pas provoquer une augmentation des défenses chez la plantule. Une différence dans l’expression des voies de défenses dans les cotylédons et le racines des plantules a aussi été observé. L’identification des déterminants génétiques bactériens impliqués dans la transmission n’a quant à elle pas pu être menée à son terme. Beaucoup de choses restent encore à découvrir afin d’aider à favoriser un microbiote bénéfique et limiter la transmission d’agents pathogènes à la plantule.
Seeds transmit beneficial, harmful, and commensal bacteria which all contribute to the health and development of the next plant generation. It is, therefore, of great importance to understand the way bacteria are transmitted to seedlings. The transmission process relies on a complex interaction taking place between bacteria and plants. Thus, (i) plant defenses limiting bacterial transmission and (ii) bacterial genetical factors enabling transmission should be studied. For this assignment, qPCR was used to assess seedling defense system activation with seeds inoculated by Xanthomonas campestris pv. Campestris or seedborne bacteria. Rb-TnSeq method was used in order to identify essential genes involved in seedling colonization by bacteria. We showed that seedling defense system was active even when confronted with only natural seed microbiota. However, pathogen inoculation did not seem to further trigger seedling defense system. We also observed that the defense system was differentially activated in roots and cotyledons of all seedlings. Identification of the genetical factors enabling bacterial transmission could, however, not be carried to an end. Research still needs to be caried in order to promote beneficial microbes and limit pathogen transmission.