Détection des Entérobactéries productrices de carbapénèmases par dépistage rectal : comparaison d’une méthode de biologie moléculaire avec la culture
| Titre | Détection des Entérobactéries productrices de carbapénèmases par dépistage rectal : comparaison d’une méthode de biologie moléculaire avec la culture |
| Type | Thèse d'exercice : Médecine |
| Auteurs | Fournel Etienne |
| Directeurs | Pailhoriès Hélène |
| Année | 2020 |
| URL | http://dune.univ-angers.fr/fichiers/16010656/2020MDEBI12595/fichier/12595F.pdf |
| Mots-clés | BDMAX, carbapénèmases, culture, dépistage |
| Résumé | Le dépistage sur écouvillon rectal du portage des entérobactéries productrices de carbapénémases (EPC) chez les patients à risque est un enjeu de santé publique majeur. Les techniques de biologie moléculaire sont rapides et performantes, mais des discordances sont observées avec la culture considérée comme la méthode de référence. L’objectif de cette étude est d’évaluer les performances de l’automate de RT-PCR multiplex BD-MAX (kit Checkpoints CPO) et d’une technique d’enrichissement recommandé par le CNR. Le BD-MAX a obtenu de bonnes performances par rapport à la culture, avec une sensibilité de 100% et une spécificité de 98,9%, malgré une valeur prédictive positive de 57%, expliquée par des résultats faux positifs. Les performances de l’enrichissement étaient faibles, avec une sensibilité de 50%. L’utilisation du BD-MAX dans la stratégie diagnostique des EPC pourrait donc être envisagée en complément de la culture afin de diminuer le délai de rendu des résultats et supprimer le plus tôt possible des mesures d’isolement coûteuses. Des études supplémentaires seraient nécessaires afin d’investiguer les résultats faux positifs obtenus par le BD-MAX et d’établir l’impact de ces résultats sur la prise en charge des patients. |
| Résumé en anglais | Screening patients for the carriage of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (CPE) on rectal swabs is a major public health issue. Molecular biology techniques are fast and efficient, but discrepancies are observed with culture, which is considered as the reference method. The objective of this study was to evaluate the performance of the BD-MAX multiplex RT-PCR assay (Checkpoints CPO Kit) and broth culture recommended by the NRC. The BD-MAX had good performance results when compared to culture, with a sensitivity of 100% and a specificity of 98.9% despite a predictive positive value of 57%, which can be explained by false positive results. The performance of the enrichment was weak, with a sensitivity of 50%. The diagnostic strategy of CPEs could therefore consider using molecular biology in addition to culture, in order to reduce time to results and avoid costly prevention measures. Further study is required in order to explain these false positive results and analyze their impact on patient care. |
| Langue de rédaction | Français |
| Nb pages | 70 |
| Diplôme | Diplôme d'État de docteur en médecine |
| Date de soutenance | 2020-10-19 |
| Editeur | Université Angers |
| Place Published | Angers |
| Libellé UFR | UFR Médecine |
| Numéro national | 2020ANGE177M |