Evaluation technique de l’analyse NGS (Next Generation Sequencing) du liquide pleural chez 28 patients atteints d’un carcinome bronchique non à petites cellules, et de sa place dans la stratégie thérapeutique
| Titre | Evaluation technique de l’analyse NGS (Next Generation Sequencing) du liquide pleural chez 28 patients atteints d’un carcinome bronchique non à petites cellules, et de sa place dans la stratégie thérapeutique |
| Type | Thèse d'exercice : Médecine |
| Auteurs | Marx Sirima |
| Directeurs | De Chabot Gonzague |
| Année | 2020 |
| URL | https://dune.univ-angers.fr/fichiers/15009150/2020MCEM12142/fichier/12142F.pdf |
| Mots-clés | adénocarcinome, cancer broncho-pulmonaire, détection de panel, EGFR, épanchement pleural, NGS, T790M, tyrosine kinase inhibiteur |
| Résumé | L’apparition d’un épanchement pleural est un événement fréquent au cours de l’histoire naturelle du cancer broncho-pulmonaire.Son prélèvement est un geste simple et peu invasif.L’analyse NGS permet de détecter des mutations d’intérêt thérapeutique en cancérologie, et notamment la présence demutationsde l’EGFR accessiblesà une thérapie ciblée par tyrosine kinase inhibiteur. Cette technique est actuellement utilisée en routine pour analyser le tissu tumoral et le plasma, mais il existe peu de données concernant son utilisation pour le liquide pleural. Dans cette étude, nous avons étudié la précision et l’efficacité de la détection de mutations dans le liquide pleural chez 28 patients atteints d’un carcinome bronchique non à petites cellules ayant eu une analyse NGS du liquide pleural entre 2017et 2020. Le kit Lung and colon est plus performant que le kit Hotspot en termes de profondeur de séquençage, et les deux kits sont plus performants en termes de fréquences alléliques dans le surnageant que dans le culot issu de la centrifugation du liquide pleural. La sensibilité est équivalente à celle du plasma. Chez 63,6% des patients avec une mutation EGFR, celle-ci n’était mise en évidence que dans le liquide pleural et/oudans le plasma, démontrant l’utilité d’associer des biopsies liquides aux biopsies tumorales parfois non réalisables en pratique clinique. Chez 45% des patients mutés EGFR de notre étude, l’altération a été mise en évidence uniquement sur le liquide pleural, permettant de guider la thérapeutique de première ligne. Il semble donc que l’analyse NGS du surnageant du liquide pleural constitue un apport non négligeable dans la recherche de mutations d’intérêt thérapeutique chez les patients porteurs d’un carcinome bronchique non à petites cellules. |
| Résumé en anglais | Pleural effusion is a common event in the natural history of bronchopulmonary cancer. Its removal is a simple and minimally invasive gesture. NGS analysis makes it possible to detect mutations of therapeutic interest in oncology, and in particular the presence of EGFR mutations. EGFR mutations can be targeted by tyrosine kinase inhibitors. This technique is currently used routinely to analyze tumor tissue and plasma, but there is little data regarding its use for pleural fluid. In this study, we investigated the accuracy and efficiency of detecting mutations in pleural fluid in 28 patients with non-small cell lung carcinoma who had NGS analysis of pleural fluid between 2017 and 2020. The Lung and Colon kit outperforms the Hotspot kit in terms of sequencing depth, and both kits perform better in terms of allele frequencies in the supernatant than in the centrifugation pellet of pleural fluid. The sensitivity is equivalent in pleural fluid and in plasma. In 63.6% of patients with an EGFR mutation, it was only detected in the pleural fluid and / or in the plasma, demonstrating the usefulness of combining liquid biopsies with tumor biopsies which are sometimes not feasible in clinical practice. In 45% of EGFR mutated patients in our study, the alteration was only demonstrated in the pleural fluid, making it possible to guide first-line therapy. It therefore appears that the NGS analysis of the pleural fluid supernatant constitutes a significant contribution in the search for mutations of therapeutic interest in patients with non-small cell bronchial carcinoma. |
| Langue de rédaction | Français |
| Nb pages | 46 |
| Diplôme | Diplôme d'État de docteur en médecine |
| Date de soutenance | 2019-04-28 |
| Editeur | Université Angers |
| Place Published | Angers |
| Libellé UFR | UFR Médecine |
| Numéro national | 2020ANGE097M |