Optimisation de l'antibiothérapie dans les PAVM : intérêt d'un diagnostic rapide par PCR FilmArray BCID sur le LBA

TitreOptimisation de l'antibiothérapie dans les PAVM : intérêt d'un diagnostic rapide par PCR FilmArray BCID sur le LBA
TypeThèse d'exercice : Médecine
AuteursFradin Eugénie
DirecteursLasocki Sigismond
Année2019
URLhttp://dune.univ-angers.fr/fichiers/14008205/2019MDEAR11294/fichier/11294F.pdf
Mots-clésFilmArray, LBA, PAVM, PCR, Réanimation
Résumé

Les pneumopathies acquises sous ventilation mécanique (PAVM) sont la première cause d’infection nosocomiale en réanimation. Les méthodes microbiologiques récentes basées sur la PCR pourraient permettre d’améliorer la rapidité d’adaptation de l’antibiothérapie. Nous avons validé le kit PCR FilmArray BCID (kit) sur des LBA d’un point de vue microbiologique. Le but de cette étude est d’évaluer son intérêt théorique sur les délais d’adaptation de l’antibiothérapie. Etude prospective, observationnelle, monocentrique, les patients ayant un LBA pour suspicion de PAVM étaient inclus. Le LBA était traité selon le protocole du service et un aliquot (200µL) était prélevé pour réaliser une PCR (kit comprenant un panel de 27 cibles). Les modifications de l’antibiothérapie étaient relevées, le patient étant pris en charge dans le cadre du soin habituel. Un expert donnait l’antibiothérapie théorique selon les résultats de la PCR et le dossier du patient anonymisé, en aveugle de la culture du LBA. Nous avons comparé les délais d’adaptation de l’antibiothérapies réelles et théoriques par test de Man Withney. P<0.05 significatif. Entre décembre 2017 et avril 2018, 24 patients ont été inclus et pour 14(58%) d’entre eux une PAVM étaient confirmée. L’antibiothérapie probabiliste était adaptée pour 12 (86%) patients. Les résultats de la PCR étaient concordants pour 10 (71%) patients. Quatre patients avaient des germes retrouvés sur le LBA et non par la PCR dont deux non présents dans le kit. Les délais médians d’antibiothérapie efficace observés et théoriques (ie selon les résultats de la PCR) étaient non différents (respectivement 0.5[0-0.75] et 0[0-0,25] jours, p=0,76), mais le délai d’adaptation (ie avec restriction du spectre) pourrait être raccourci avec la PCR (1.7[0-3] vs 0[0-0,25] jours, p=0,04). Dans notre série ; l’utilisation de la PCR FilmArray sur les LBA chez les patients suspects de PAVM pourrait permettre de gagner près de 2 jours pour l’adaptation de l’ATB. L’agrément entre cette PCR (normalement prévue pour les hémocultures) et la culture du LBA est correcte (coefficient kappa 0,73[0,63-0,82]). Il convient de rester prudent, d’autant plus que certaines bactéries ne sont pas reconnues.
Résumé en anglais

Ventilated associated pneumoniae (VAP) are the most common causes of nosocomial infection in intensive care unit. The newly developed microbiology technologies based on PCR could improve the adaptation of the antibiotics. We validated the kit PCR FilmArray on the BAL a microbiologic perspective. The aim of this study is to evaluate the benefits of using the method of PCR FilmArray on the adaptation of the antibiotic for the VAP.
Prospective, observational, study, in one center, patients who had a BAL for a VAP suspected were included. The BAL was treated as the usual protocol and a 200 µL aliquot was withdrawn for the PCR. The patients were treated with our usual cares. We noted the antibiotics modifications. Our expert expressed the antibiotic which could be prescribed with PCR results in the case of each patient anonymised folders without the culture results of BAL. We compared the time for antibiotic treatment adaptation between real and theorical antibiotic (with the help of PCR results) by Man Withney test. P<0.05 significant. Between 2017 december and 2018 april, we included 24 patients and the VAP was confirmed by culture for 14 (58%). The probabilistic antibiotic was efficient for 12 (86%) patients. The PCR results matched for 10 (71%) patients. Four patients had seeds in the culture of BAL and not in the PCR results, two were not in the panel. The median time for an efficient antibiotic treatment without or with PCR results were not different (respectively 0.5[0-0.75] and 0[0-0.25] days, p=0.76), but the time for the most efficient antibiotic (ie with restricted spectrum) could be shorter with the use of PCR result (1.7[0-3] vs 0[0.25], p=0.04). In our study, the use of PCR FilmArray on the BAL for suspected VAP could improve the adaptation of antibiotic around 2 days. The correlation between this PCR (normally used for blood culture) and the BAL culture is good (k coefficient 0.73 [0.63-0.82]. We must use this technic carefully, and to remember the panel isn’t comprehensive.
Langue de rédactionFrançais
Nb pages21
Diplôme

Diplôme d'État de docteur en médecine
Date de soutenance2019-09-11
EditeurUniversité Angers
Place PublishedAngers
Libellé UFR

UFR médecine
Numéro national2019ANGE149M