Etude de l’interaction entre la bactérie Xanthomonas arboricola pv. pruni et Prunus armeniaca : détection et phénotypage sur feuilles détachées
| Titre | Etude de l’interaction entre la bactérie Xanthomonas arboricola pv. pruni et Prunus armeniaca : détection et phénotypage sur feuilles détachées |
| Type | Rapport de stage |
| Auteurs | Jayet Thibaud |
| Directeurs | Boureau Tristan |
| Année | 2019 |
| URL | http://dune.univ-angers.fr/fichiers/17005543/2019TMBV10585/fichier/10585F.pdf |
| Mots-clés | abricotier, émergence, pouvoir pathogène, qPCR spécifique, test de sensibilité, Xap |
| Résumé | Xanthomonas arboricola pv. pruni (Xap), agent de la bactériose des Prunus spp., cause d’importants dégâts dans les vergers d’abricotier. L’émergence récente de cette bactérie dans de nombreux pays européens incite les chercheurs à développer de nouvelles méthodes de lutte notamment par la création de cultivars résistant à Xap. Une étude de génomique comparative incluant 86 génomes a abouti à la création d’un couple d’amorces et d’une sonde TaqMan pour une qPCR spécifique des trois pathovars majeurs de Xanthomonas arboricola dont Xap fait partie. La spécificité du triplet a été testée sur une collection de 94 souches. Plusieurs techniques d’inoculation (infiltration sous vide, blessures) ont été testées sur des feuilles détachées d’abricotier. Les tests ont été pratiqués avec une souche représentative du clone épidémique de Xap et avec des souches de X. arboricola isolées de Prunus mais considérées comme avirulentes. De façon inattendue ces dernières provoquent des symptômes de macération dès 24h alors que Xap ne produit des symptômes visibles qu’à partir de sept jours après inoculation. L’infiltration a permis de révéler des symptômes typiques de Xap. Cependant la méthode par blessures a l’avantage d’être plus reproductible (mesure quantitative des symptômes). L’inoculation de Xap par cette méthode standardisée a révélé une forte sensibilité du cultivar Tomcot par rapport au cultivar sensible de référence Goldbar. |
| Résumé en anglais | Xanthomonas arboricola pv. pruni (Xap), the causal agent of bacterial spot disease on Prunus spp. is responsible for major damages in apricot orchards. Due to the recent emergence of Xap across Europe, researchers tend to develop new methods to fight against the bacteria mainly by creating resistant apricot trees. A comparative genomic study of 86 genomes was previously carried out to create Xap specific primers and probe used in qPCR. The triplet specificity was investigated in a 94 strain collection. Several inoculation techniques (vacuum infiltration, wounding) were tested on detached apricot-tree leaves. These techniques were carried out with a representative strain of the Xap epidemic clone and with Prunus-isolated X. arboricola strains considered as non-pathogenic. Surprisingly, these strains were responsible of bacterial spots within 24h while Xap symptoms were only visible seven days post-inoculation. Vacuum infiltration technique revealed typical Xap-symptoms. However the wounding method was much more reproducible (quantitative measure of symptoms). According to field observations, the Tomcot variety was very susceptible in comparison to the susceptible reference variety Goldbar, by using this standardized technique. |
| Langue de rédaction | Français |
| Nb pages | 23 |
| Diplôme | Master Biologie Végétale |
| Date de soutenance | 2019-06-14 |
| Editeur | Université Angers |
| Place Published | Angers |
| Entreprise | Institut de Recherche en Horticulture et Semences |
| Tuteur | Tristan Boureau |
| Libellé UFR | UFR de Sciences |